Adapt Tramp specific tests in eglot-tests.el

* test/lisp/progmodes/eglot-tests.el (tramp): Move up.
(tramp-sh): Don't require.
(eglot--cleanup-after-test): Delete Tramp buffers if needed.
(eglot-tests-lsp-abiding-column): Rename from `eglot-lsp-abiding-column'.
(tramp-histfile-override): Declare.
(eglot--call-with-tramp-test):
Use `ert-remote-temporary-file-directory'.  Skip if needed.
(eglot--tramp-test, eglot--tramp-test-2): Don't skip.

* lisp/textmodes/texinfo.el (texinfo-flymake): Improve docstring.

Support a function in the BUFFER-LIST arg of list-buffers-noselect (bug#59935)

* lisp/buff-menu.el (Buffer-menu-buffer-list): New buffer-local variable.
(list-buffers-noselect): Set Buffer-menu-buffer-list to 'buffer-list'
that now keeps the buffer-local value of the provided buffer list
or a function that returns the buffer list.
(list-buffers--refresh): Handle buffer-list and Buffer-menu-buffer-list
as a function and as a list.

* lisp/progmodes/project.el (project-list-buffers): Let-bind
'buffer-list-function' used by both legacy code and the new version
of list-buffers-noselect that supports its arg BUFFER-LIST as a function.

; Fix typos

Don't allow lazy highlight from recursive minibuffers

See bug#59918.

* lisp/isearch.el (minibuffer-lazy-highlight-setup): Don't activate
when starting a recursive minibuffer.

Improve resetting face attributes when looking for suitable fonts

* src/xfaces.c (syms_of_xfaces)<face-font-lax-matched-attributes>:
Change the default value to t.  Update doc string.
(realize_gui_face): When 'Vface_font_lax_matched_attributes' is t,
reset the 3 default font attributes efficiently.  Call
'font_maybe_unset_attribute' only if the value is neither nil nor
t.  (Bug#59347)

; Fix typos in doc strings

* lisp/treesit.el (treesit-defun-tactic)
(treesit-default-defun-skipper): Fix typos in doc strings.

; * lisp/bs.el (bs-attributes-list): Doc fix

Add lexical-binding to example package header

* doc/lispref/package.texi (Simple Packages): Add lexical-binding
cookie to example package header.

Add improved tree-sitter navigation

This new set of functions (and tests) should eliminate
defun-navigation bugs and limitations we currently have.  This commit
doesn't change any existing bahavior: treesit-beginning/end-of-defun
and friends are unchanged.  The plan is to later switch gear and
replace the current functions with the new ones introduced in this
change.

This is a relatively big change, but I've setup a comprehensive test,
and it should fix current bugs, so I think it's ok to put it on the
release branch.

The gist of the new navigation is to use treesit--defuns-around to
find the previous sibling defun, next sibling defun, and the parent
defun, then use this information to move to previous/next
beginning/end of defun in treesit--navigate-defun.

I also added comprehensive testing that tests all four possible
operations (prev-beg, next-beg, prev-end, next-end) starting at all
possible positions (between two sibling defuns, inside a sibling
defun, etc).

* lisp/treesit.el (treesit-defun-type-regexp): Expand definition to
allow (REGEXP . FILTER).  Old functions don't support this, but it
should be fine since we are soon replacing them.

(treesit-defun-tactic)
(treesit-defun-skipper): New variables.

(treesit-default-defun-skipper)
(treesit--defuns-around)
(treesit--top-level-defun)
(treesit--navigate-defun): New functions.

* test/src/treesit-tests.el (treesit--ert-insert-and-parse-marker)
(treesit--ert-collect-positions)
(treesit--ert-test-defun-navigation): New helper functions.

(treesit--ert-defun-navigation-python-program)
(treesit--ert-defun-navigation-js-program)
(treesit--ert-defun-navigation-bash-program)
(treesit--ert-defun-navigation-nested-master): New variables.

(treesit-defun-navigation-nested-1)
(treesit-defun-navigation-nested-2)
(treesit-defun-navigation-nested-3)
(treesit-defun-navigation-top-level): New tests.

; * test/src/treesit-tests.el: Add outline headers.

Add cross-reference to flush-lines

* lisp/replace.el (flush-lines, kill-matching-lines): Add
cross-references between commands, using the names
'(kill|delete)-matching-lines' for symmetry.  (Bug#59934)

Use font-lock-number-face for numeric values in csharp-mode

(bug#60004)

* lisp/progmodes/csharp-mode.el: update fontification code.

Make treesit-query-validate create a read-only buffer

* lisp/treesit.el: use view-mode for generated validation buffer.

Improve dockerfile-ts-mode imenu generation (Bug#59979)

* lisp/progmodes/dockerfile-ts-mode.el (treesit-node-child-by-field-name):
Declare.
(dockerfile-ts-mode--imenu-1): Use stage name if available.

Add "->" to python--treesit-operators (bug#59968)

* lisp/progmodes/python.el (python--treesit-operators): Add "->", used
to specify the return types of functions in Python.

; * admin/notes/tree-sitter/build-module/build.sh: Add -fPIC.

(bug#59967)

Align C++ access specifiers to their enclosing class/struct/union

(bug#59966)

The default style in c++-mode aligns access specifiers like "private",
"public" or "protected" to their enclosing class, struct, or union.
The "ellemtel" style indents access specifiers, but this C++ style is
not supported by c++-ts-mode yet.

* lisp/progmodes/c-ts-mode.el (c-ts-mode--indent-styles): Align access
specifiers to their enclosing class/struct/union.

Add cmake-ts-mode

* admin/notes/tree-sitter/build-module/batch.sh:
* admin/notes/tree-sitter/build-module/build.sh: Add cmake support.
* etc/NEWS: Mention it.
* lisp/progmodes/cmake-ts-mode.el: New major mode with
tree-sitter support.
* lisp/progmodes/eglot.el (eglot-server-programs): Add it.

Tweak various ts-mode's indent and fontification (bug#59931)

* lisp/progmodes/c-ts-mode.el (c-ts-mode--font-lock-settings): Add raw
string literal font-locking.
* lisp/progmodes/java-ts-mode.el (java-ts-mode--indent-rules): Add
text_block indent rule.
(java-ts-mode--font-lock-settings): Add text_block font-locking.
* lisp/progmodes/js.el (js-ts-mode): Prefer top-level navigation.
* lisp/progmodes/json-ts-mode.el (json-ts-mode--font-lock-settings):
Add comment feature.
(json-ts-mode): Use comment feature.
* lisp/progmodes/typescript-ts-mode.el (typescript-ts-base-mode):
Prefer top-level navigation.

Add expression for generic_name in csharp-ts-mode (bug#59897)

Given the below example, we want 'services' to be font-locked in
'font-lock-variable-name-face' in all cases.  Previously this only
worked in the first case, and the other was font-locked as
'font-lock-function-name-face'.

namespace Foo {
    void Foo() {
        services.Add();
        services.Add<MyType>();
    }
}

* lisp/progmodes/csharp-mode.el (csharp-ts-mode--font-lock-settings):
Add new query that makes the mentioned example work.

; Adjust eglot test to recent autopep8/pycodestyle

* test/lisp/progmodes/eglot-tests.el (python-autopep-formatting):
Support more recent autopep8/pycodestyle.

; Avoid compilation warning on MS-Windows

* src/timefns.c (sys_clock): Declare, to avoid compilation
warning.

* lisp/outline.el: Fix the value 'insert' of outline-minor-mode-use-buttons.

(outline--insert-button): Keep text properties around point
on the inserted whitespace placeholder.

* lisp/apropos.el (apropos-mode):
* lisp/progmodes/xref.el (xref--xref-buffer-mode):
Change outline-minor-mode-use-buttons from t to 'insert'.

* lisp/minibuffer.el (completions-group-separator): Revert f7816c94b6.

Change face attribute from :underline back to :strike-through.
https://lists.gnu.org/archive/html/emacs-devel/2022-10/msg01792.html

; Skip two eglot tests when typescript is missing

* test/lisp/progmodes/eglot-tests.el
(javascript-basic, project-wide-diagnostics-typescript): Skip tests
when the npm package "typescript" is not installed.

; Remove outdated text describing overlays

* doc/lispref/display.texi (Overlays): Remove outdated text.
(Bug#59996)

Skip Eglot rust-analyzer tests if 'cargo' isn't available

* test/lisp/progmodes/eglot-tests.el
(project-wide-diagnostics-rust-analyzer)
(diagnostic-tags-unnecessary-code): Skip unless "cargo" is found.

use-package.texi: New section "Manual installation"

* doc/misc/use-package.texi (Manual installation): New section.
(Load path, Manual autoloads): Make into subsections of above new
section.

Revert "Revert "Improve last change to xfaces.c" (05ece1eb8b)"

This reverts commit b8d2ec920f37f5d77d32440eefc97dd5e8c2c7dc.

Not only does it make debugging Emacs harder for users, that change is
unsafe for the Haiku port.

Revert "Improve last change to xfaces.c" (05ece1eb8b)

* src/xfaces.c: Revert 05ece1eb8b.

See https://debbugs.gnu.org/cgi/bugreport.cgi?bug=59347#331.

Do not pare arguments unnecessarily.

* lisp/pcomplete.el (pcomplete-here-using-help): Do not pare
arguments.  Fixes bug#59803.

Add automated tests for Eglot

Most of the tests require a specific LSP server to do their thing, and
skip themselves if this server isn't found.

This file is a modified/overhauled version of the original Eglot
automated tests that were developed in the old GitHub upstream.

* test/lisp/progmodes/eglot-tests.el: New file.

Eglot: allow skipping compile-time warnings about LSP interfaces

* lisp/progmodes/eglot.el (eglot-strict-mode): Add 'no-unknown-interfaces'.
(eglot--check-object): Honour new eglot-strict-mode value.

; project.el: Bump version.

Add customizale faces for tree-sitter explorer

* lisp/treesit.el (treesit-explorer-anonymous-node)
(treesit-explorer-field-name): New face.
(treesit--explorer-draw-node): Use the new faces.
(treesit-explore-mode): Change playground to explorer.

Fix error message when installing non-existent package

* lisp/emacs-lisp/package.el (package-compute-transaction): Don't add
trailing dash to package name in non-existent package
error.  (Bug#59923)

Don't use diff-mode buffer as a patch when it's visiting a file (bug#59962)

* lisp/vc/vc.el (vc-deduce-fileset-1): Don't call diff-vc-deduce-fileset
for diff-mode when buffer-file-name is non-nil.  This is because in this case
a file with a diff might be committed to VCS.  So don't use it as a patch
to commit with 'C-x v v'.

Fix pcase rx patterns using rx-let bindings (bug#59814)

Reported by Daniel Pittman.

* lisp/emacs-lisp/rx.el (rx): Move binding of rx--local-definitions...
(rx--to-expr): ...here.
* test/lisp/emacs-lisp/rx-tests.el (rx-let-pcase): New test.

Fix use-package-defaults defcustom type (bug#59941)

* lisp/use-package/use-package-core.el (use-package-defaults):
Enlarge type to allow for keywords such as :ensure and :pin to be
added later, remedying a failure in test-custom-opts.

; * lisp/use-package/bind-key.el: Remove ineffective backslashes.

; * lisp/progmodes/dockerfile-ts-mode.el: use \' instead of $

* lisp/language/indian.el: Improve Brahmi composition rules. (bug#58957)

; Minor cleanup of last change in xfaces.c.

; Improve docs of relaxing face-font attribute match (bug#59347)

* src/xfaces.c (realize_gui_face): Fix typo and coding style.
(syms_of_xfaces) <face-font-lax-matched-attributes>: A better name.

; * doc/misc/use-package.texi: Prepare for GNU ELPA.

; Unbreak bootstrap

* lisp/progmodes/dockerfile-ts-mode.el (auto-mode-alist): Wrap
autoloaded definition using the rx macro in eval-and-compile.

Improve last change to xfaces.c

* src/xfaces.c (font_unset_attribute): New function.
(realize_gui_face): Improve commentary and use list instead of
bitmask.
(syms_of_xfaces): Get rid of bitmask.  Replace it by a list,
there is no reason any user should have to think about bitmasks
in Emacs lisp.

; Auto-commit of loaddefs files.

; * admin/git-bisect-start: Fix commit hash

; Fix use-package-ensure-system-package macOS footnote

* doc/misc/use-package.texi (use-package-ensure-system-package): Fix
macOS footnote.

Actually improve detection of long lines

* src/xdisp.c (redisplay_window): Update condition.

* src/xdisp.c (mark_window_display_accurate_1):
* src/pdumper.c (dump_buffer):
* src/buffer.h (BUF_CHARS_UNCHANGED_MODIFIED):
(struct buffer_text):
* src/buffer.c (Fget_buffer_create):
Revert 1c837c42c2, which was misguided.

; Improve checkdoc.el commentary section

* lisp/emacs-lisp/checkdoc.el: Improve wording of Commentary.
(checkdoc): Link commentary from defgroup.

Unset the weight/slant/width in the spec when realizing a font

Between commits bf0d3f76dc (2014) and 6b1ed2f2c9 (2022),
realize_gui_face called font_load_for_lface with an empty or
partly emptied font spec, i.e. it ignored a part of its attrs
argument.  The rationale given in bug#17973, which led to
bf0d3f76dc, is not clear.  However, 6b1ed2f2c9, which passes
the full font spec to font_load_for_lface and
font_find_for_lface, leads to suboptimal font choices, for
example when the font chosen for the default face has a
weight, slant or width that is not supported by other
available fonts on the system, such as 'medium' or 'heavy'.

If these attributes are not unset here, the call to
font_list_entities in font_find_for_lface arbitrarily limits
the candidate font list to those that are perfect matches for
these attributes, which means that the scoring mechanism is
bypassed.  Note that the size attribute in spec is also unset,
in font_find_for_lface.

Also allow unsetting the other attributes, for debugging purposes.

* src/xfaces.c (realize_gui_face): Unset the weight, slant and
width of the font spec.  Fixes bug#57555 and bug#59347.
(syms_of_xfaces): New variable
'realize-gui-face-ignored-spec-attributes'.

Update to Org 9.6-31-g954a95

; tabulated-list.el: Remove duplicate obsolete declaration

* lisp/emacs-lisp/tabulated-list.el
(tabulated-list-line-number-width): Remove second
`define-obsolete-function-alias' for the same function.

; * doc/misc/use-package.texi: Fix misplaced @end group.

; * doc/lispref/keymaps.texi (Searching Keymaps): Fix a typo (bug#59886).

Fix infloop in 'shell-resync-dirs' with tcsh

* lisp/shell.el (shell-resync-dirs): Remove trailing slash from
output of 'dirs', for csh/tcsh's sake.  (Bug#59804)

; Fix some minor issues in use-package.texi

* doc/misc/use-package.texi: Fix some minor issues.

; Fix a failure when running server-tests via the command line

* test/lisp/server-tests.el
(server-tests/server-force-stop/keeps-frames): Delete every new frame
created during the test.  On some systems, 'delete-terminal' will
delete the frames for us, so this ensures that if there are no new
frames, nothing happens.

(cherry picked from commit 3785fe52e4692ffef14c0a1e50361c22d66fabe8)

; Fix two byte-compiler warnings

* lisp/gnus/gnus-icalendar.el (gnus-icalendar--show-org-event):
* test/lisp/progmodes/project-tests.el (project/quoted-directory):
Fix warnings.

Ensure 'package-vc--version' always returns a version

* lisp/emacs-lisp/package-vc.el (package-vc--version): Return "0" even
if the main file exists, but lacks version headers.

Ensure 'package-vc--main-file' always returns an existing file

* lisp/emacs-lisp/package-vc.el (require): Explicitly require cl-lib.
(package-vc--main-file): If the expected file name is missing, try and
find the closest match.

Check if package already exists before installing from checkout

* lisp/emacs-lisp/package-vc.el (package-vc-install-from-checkout):
Copy check from 'package-vc--unpack'.

; Fix reference in docstring to 'package-vc-install-from-checkout'

* lisp/emacs-lisp/package-vc.el (package-vc-checkout): Fix reference.

Refresh the package quickstart file in package-vc

* lisp/emacs-lisp/package-vc.el (package-vc--unpack-1): Call
`package--quickstart-maybe-refresh', just as
`package-install-from-buffer' does.  (bug#59728)

; * admin/notes/tree-sitter/starter-guide (Indent): Minor fix.

Make indirect buffers use tree-sitter parsers of their base buffer

Fix the problem described in bug#59693.

* src/treesit.c (treesit_record_change): Always use the base buffer.
(Ftreesit_parser_create): Always use the base buffer.  Also change the
for loop into FOR_EACH_TAIL (stylistic change).
(Ftreesit_parser_list): Always use the base buffer.

* doc/lispref/parsing.texi (Using Parser): Update manual.
* test/src/treesit-tests.el (treesit-indirect-buffer): New test.

Fontify "this" as a keyword in c++-ts-mode (bug#59924)

* lisp/progmodes/c-ts-mode.el (c-ts-mode--font-lock-settings):
Following c++-mode, fontify as a keyword instead of a constant.

Add class_body indentation for typescript (bug#59680)

* lisp/progmodes/typescript-ts-mode.el
(typescript-ts-mode--indent-rules): New indent rule.

Make more granular defun-type-regexp (bug#59873)

We don't want to match local_variable_declaration and others to hit on
beginning-of-defun.  The fix is just to make the regexp a bit more
granular.

* lisp/progmodes/java-ts-mode.el (java-ts-mode): Use regexp-opt to
distinguish more granularly.

Add dockerfile-ts-mode (Bug#59894)

* admin/notes/tree-sitter/build-module/batch.sh: Add dockerfile support.
* admin/notes/tree-sitter/build-module/build.sh: Support different
namespaces and add dockerfile support.
* etc/NEWS: Mention it.
* lisp/progmodes/dockerfile-ts-mode.el: New major mode with
tree-sitter support.
* lisp/progmodes/eglot.el (eglot-server-programs): Add it.

Fix fontification of method-invocations in js-ts-mode (bug#59904)

* lisp/progmodes/js.el (js--treesit-font-lock-settings): Move rules
for property in front of function names, so function names override
property.

Fix escape-sequence feature in typescript-ts-mode (bug#59906)

* lisp/progmodes/typescript-ts-mode.el: (typescript-ts-mode,
tsx-ts-mode): Use escape-sequence feature.

Improve fontification in csharp-ts-mode (bug#59909)

- Fontity escape sequences.
- Highlight syntax errors.

* lisp/progmodes/csharp-mode.el (csharp-ts-mode--font-lock-settings)
(csharp-ts-mode): Add new features

Use 'project--value-in-dir' for 'project-vc-include-untracked' too

* lisp/progmodes/project.el (project--vc-list-files): Use
'project--value-in-dir' for 'project-vc-include-untracked' too.
So that is can be reliably set through dir-locals.

Update Turkish Hello

* etc/HELLO (Turkish):
* lisp/language/european.el ("Turkish"): Add a Turkish Hello.
Suggested by YUSUF ALPER ÇIKIŞIR <yusufcikisir@std.iyte.edu.tr>.

Support newer glib versions (Bug#59061)

* lib-src/seccomp-filter.c (main): Allow pidfd_open system call

; * doc/misc/use-package.texi: Fix @file.

Merge branch 'emacs-29' of git.savannah.gnu.org:/srv/git/emacs into emacs-29

; * doc/misc/use-package.texi: Fix @acronym.

Bring back the project--value-in-dir logic

Essentialy revert commit 2389158a31b4a12, restoring the changes
and fixing the conflicts.  Motivated by the problem brought up in
bug#59722 (behavior of project-find-files/regexp when switching
projects).  We should find other ways to improve performance.

* lisp/progmodes/project.el
(project--value-in-dir, project--vc-merge-submodules-p): Restore.
(project-try-vc, project-files, project--vc-list-files)
(project-ignores, project-buffers): Use.

* test/lisp/progmodes/project-tests.el
(project-vc-supports-project-in-different-dir): New test.

* test/lisp/progmodes/project-resources/.dir-locals.el:
* test/lisp/progmodes/project-resources/foo:
* test/lisp/progmodes/project-resources/etc: New files.

Backport: Enable native speed 2 EMBA build and tests and disable speed 0

* test/infra/gitlab-ci.yml (build-native-comp-speed2): Uncomment.
(build-native-comp-speed0): Comment.
(test-native-comp-speed0): Remove.
(test-native-comp-speed2): Add.

(cherry picked from commit 06bf218f69a62d5d5c8d3b3767d7db8d9fb4bb9f)

* test/infra/test-jobs.yml: Regenerate for the new use-package subdirectory.

Adapt manual names in emacs-news-mode

* lisp/textmodes/emacs-news-mode.el (emacs-news--buttonize):
Allow hyphen in manual names.

; * etc/NEWS: Fix typos.

; * doc/misc/use-package.texi: Fix indexing.

; * lisp/erc/erc.el (erc-default-target): Fix comment.

Respect some spaces in auth-source-pass--match-regexp

* lisp/auth-source-pass.el (auth-source-pass--match-regexp): Allow an
entry's host and user fields to contain spaces, just like other
backends do.
* lisp/erc/erc-compat.el
(erc-compat--29-auth-source-pass--retrieve-parsed): Change regexp to
allow spaces in host and user components of file names.
* test/lisp/auth-source-pass-tests.el (auth-source-pass-any-host):
Silence warning message re wildcards emitted by
`auth-source-pass-search'.
(auth-source-pass-extra-query-keywords--suffixed-user): Add spaces
to users and hosts of some example entries.  (Bug#58985.)

; Improve the use-package manual

* doc/misc/use-package.texi (Top, Basic Concepts)
(Getting Started, Loading Packages, Loading basics)
(Deferring loading, Forcing loading, Conditional loading)
(Loading sequentially, Load dependencies, Load path)
(Manual autoloads, Configuring Packages, Lisp Configuration)
(Preface keyword, Init keyword, Best practices, Key bindings)
(Global keybindings, Binding in keymaps, Binding to a keymap)
(Binding to repeat-maps, Displaying keybindings)
(Modes and interpreters, Magic handlers, User options, Faces)
(Delight, Diminish, Install package, Pinning packages)
(Other package managers, Byte-compiling, Troubleshooting)
(Troubleshooting Options, Gathering Statistics)
(Disabling a package, Keyword extensions)
(use-package-ensure-system-package, Creating an extension): Fix
wording, punctuation, typos, and markup; add indexing.  Add
@group..@end group in code examples.

; Prefer HTTPS to HTTP in some URLs

Eglot: Handle LSP progress with Emacs progress reporters (bug#59149)

Co-authored-by: João Távora <joaotavora@gmail.com>
* lisp/progmodes/eglot.el (eglot-report-progress): New custom variable.
(eglot-lsp-server): New slot for tracking active progress reporters.
(eglot-handle-notification (eql $/progress)): New method.

The LSP spec describes methods for reporting progress on long running
jobs to the client:

https://microsoft.github.io/language-server-protocol/specifications/lsp/3.17/specification/#progress
https://microsoft.github.io/language-server-protocol/specifications/lsp/3.17/specification/#workDoneProgress

This change reports those notifications in the minibuffer as they come
in.  It shows a percent indicator (if the server provides theme), or a
spinner.

This change could open the door for writing a "cancel long running
request" command, which are identified by these progress
notifications.  See
https://microsoft.github.io/language-server-protocol/specifications/lsp/3.17/specification/#window_workDoneProgress_cancel

* doc/misc/eglot.texi (Customizing Eglot): Describe new variable.

Eglot: cleanup whitespace and indentation

Co-authored-by: João Távora <joaotavora@gmail.com>
* lisp/progmodes/eglot: Misc whitespace fixes.

Better test-custom-opts diagnostics

Make it easier to understand errors from the test-custom-opts test by
reporting variable values and types that didn't match.

* admin/cus-test.el (cus-test-errors): Richer contents.
(cus-test--format-error): New.
(cus-test-apropos, cus-test-errors-display, cus-test-opts):
Use new format.

; Fix groff warnings in man pages

This fixes check-man-pages warnings such as:
troff: doc/man/etags.1:203: warning: escape character ignored before '='

* doc/man/etags.1: Fix groff warnings.

New script admin/check-man-pages

* admin/check-man-pages: New file with script used to check man pages
for errors.  (Bug#59631)
* admin/make-tarball.txt: Document when to use the above script.

; Mention flush-lines in kill-matching-lines docstring

* lisp/replace.el (kill-matching-lines): Add cross-reference to
flush-lines.

; Fix typos

; Improve use-package-autoload-keymap docstring

* lisp/use-package/use-package-bind-key.el
(use-package-autoload-keymap): Improve docstring.