Fix several todo-mode.el item editing bugs (bug#63811)

* lisp/calendar/todo-mode.el (todo-insert-item--basic): With
insertion type 'here', ensure item is inserted on the todo-mode
line where the command was invoked.
(todo-edit-item--cat, todo-edit-item--pos): New variables.
(todo-edit-item--text): Restrict the scope of nil-valued
buffer-read-only to the functions that change buffer text.  If
user moved point while editing a single-line todo item or a done
item comment, or while inserting a done item comment, restore
point, and for comments, make sure the done items section is
displayed.  For multiline items, set the new variables so
todo-edit-quit can use them.
(todo-edit-quit): Use the values of the new variables to restore
point in the todo-mode buffer if it had been moved while editing.
(todo-edit-item--header): Avoid clobbering match data when editing
a todo item header.

dockerfile-ts-mode: Prevent empty categories in imenu (Bug#63759)

* lisp/progmodes/dockerfile-ts-mode.el (dockerfile-ts-mode--imenu):
Don't include empty categories.

Brush up doc strings and terminology in plstore.el

* lisp/plstore.el (plstore-encoded, plstore-passphrase-callback-function)
(plstore--init-from-buffer, plstore-revert, plstore-close)
(plstore--merge-secret, plstore--decrypt, plstore--match, plstore-find)
(plstore-get, plstore-put, plstore-delete, plstore--insert-buffer)
(plstore-save, plstore--encode, plstore--decode)
(plstore--write-contents-functions, plstore-mode-decoded)
(plstore-mode): Brush up doc strings and documentation in general.
Fix terminology, in particular spurious occurences of all uppercase
"PLSTORE".  (Bug#63627)

Add internal documentation on plstore.el

* lisp/plstore.el: Add internal documentation and some words of
warning in the user documentation.  (Bug#63627)

Add compact_constructor_declaration font-locking to java-ts-mode

* lisp/progmodes/java-ts-mode.el (java-ts-mode--font-lock-settings):
New pattern.

* lisp/tmm.el (tmm-completion-delete-prompt): Add more checks (bug#63754).

In case when 'completions-header-format' is nil, the first 'mouse-face'
property is at the beginning of the buffer.  So first use 'get-text-property'
at point-min.

Allow to disable the DWIMish behavior of 'x' in package menu

* lisp/emacs-lisp/package.el
(package-menu-use-current-if-no-marks): New defcustom.
(package-menu-execute): Use it.  (Bug#62563)

* etc/NEWS: Announce the new option.

Allow dired to invoke secondary browser

'browse-url-of-dired-file' always invokes the primary browser, but
sometimes it's handy to call a different browser, which is why
'browse-url-secondary-browser-function' exists.

* lisp/net/browse-url.el (browse-url-of-dired-file): Call
'browse-url-secondary-browser-function' when invoked with a prefix
argument.
* etc/NEWS: Announce the change.

Add a binding for enriched-toggle-markup

* lisp/textmodes/enriched.el (enriched-mode-map): Bind
'enriched-toggle-markup' to 'M-o m'.
* etc/NEWS: Announce the change.

Fix order of tmm-menubar when 'tmm-mid-prompt' is nil

* lisp/tmm.el (tmm-prompt): Reverse 'tmm-km-list' when
'tmm-mid-prompt' is nil, to present the menu in the correct order.
Suggested by Thiago Melo <tmdmelo@gmail.com>.

Fix regression when saving tramp-default-proxies-alist (Do not merge)

* lisp/net/tramp.el (tramp-add-hops): Suppress `signal-hook-function'.
Save `tramp-default-proxies-alist' only when changed.

Save the tree-sitter grammar recipe when installing a grammar

Raised in bug#63750, but not the main subject of it.

* lisp/treesit.el (treesit-install-language-grammar): Save the recipe
to treesit-language-source-alist when installation is successful.

Add instructions and test file for VS-15/VS-16

* admin/notes/unicode: Add instructions for emoji-variation-sequences.txt
* admin/unidata/emoji-variation-sequences.txt: New file, imported from
Unicode 15.

A better fix for "Fix cancellation of Wdired"

* lisp/wdired.el (wdired-abort-changes): Call
`dired-build-subdir-alist' instead of `dired-revert'.
(Bug#63676)

; * lisp/minibuffer.el (completions-header-format): Doc fix.

Fix tmm-menubar when 'tmm-completion-prompt' is nil

* lisp/tmm.el (tmm-prompt): Handle nil value of 'tmm-mid-prompt'.
(tmm-completion-delete-prompt): Don't rely on the exact text of
the completion heading line, as it is now a customizable format
string, and can be nil, meaning no heading line is inserted at
all.  Instead, search for the first character of the menu based on
text properties used for it.  (Bug#63754)

; * lisp/progmodes/project.el: avoid warning in loaddefs.

(cherry picked from commit 1eb5faa26113afe5895955a74594e3d7cf6ffe98)

; * src/lread.c (read0, skip_lazy_string): Fix commentary again.

Use 'font-lock-extend-region-functions' in python-mode

* lisp/progmodes/python.el (python-font-lock-extend-region): Change
arguments and return value for 'font-lock-extend-region-functions'.
(python-mode): Change from
'font-lock-extend-after-change-region-function' to
'font-lock-extend-region-functions'.  (Bug#63622)

Fix python-info-docstring-p

* lisp/progmodes/python.el (python-info-docstring-p): Stop using
python-rx string-delimiter.

* test/lisp/progmodes/python-tests.el
(python-font-lock-escape-sequence-bytes-newline)
(python-font-lock-escape-sequence-hex-octal)
(python-font-lock-escape-sequence-unicode)
(python-font-lock-raw-escape-sequence): Mark as expected failures
until another bug in 'python-info-docstring-p' is corrected.
(python-info-docstring-p-7): New test.  (Bug#63622)

; * src/lread.c (read0, skip_lazy_string): Fix commentary wording.

Fix cancellation of Wdired

* lisp/wdired.el (wdired-abort-changes): Call 'dired-revert'.
Patch by Stephen Berman <stephen.berman@gmx.net>.  (Bug#63676)

Merge branch 'emacs-29' of git.savannah.gnu.org:/srv/git/emacs into emacs-29

Handle #@00 in new reader in a compatible way (bug#63722)

This was a regression from Emacs 28.

* src/lread.c (skip_lazy_string, read0): Make #@00 read as nil, which
is a quirk from the old reader that we preserve for compatibility.
* test/src/lread-tests.el (lread-skip-to-eof): Verify it.

Reported by Richard Newton.

; Minor fixes in documentation of recently-changed VC commands

* lisp/vc/vc.el (vc-print-branch-log, vc-create-branch)
(vc-create-tag, vc-retrieve-tag, vc-switch-branch): Doc fixes.
* lisp/vc/vc-hooks.el (vc-menu-map): Minor wording change in :help
text.

* doc/emacs/maintaining.texi (VC Change Log, Creating Branches):
Minor wording and markup changes.

; * etc/NEWS: Describe the Cairo XCB option.  (Bug#63589)

Don't mark selection request events

* src/pgtkterm.c (mark_pgtkterm): Prevent crash by not marking
selection request events, which don't have Lisp_Object members.

Disable cairo-xcb support by default

* INSTALL (--with-cairo-xcb): Document new option.
* configure.ac (USE_CAIRO_XCB): Implement new option.

* lisp/progmodes/project.el: Move :safe from defcustom to autoload (bug#63469)

(project-vc-ignores, project-vc-merge-submodules)
(project-vc-include-untracked, project-vc-name)
(project-vc-extra-root-markers, project-kill-buffers-display-buffer-list):
Autoload the line that puts 'safe-local-variable' property on defcustom symbol
instead of using the :safe keyword.

* lisp/vc/vc-annotate.el (vc-annotate-mode-menu): Quote vc-annotate-backend.

When unquoted it might get the nil value when vc-annotate.el is loaded
in non-vc-controlled buffer (bug#63689).

Add vc-create/switch/print-branch to menu and update documentation (bug#63690)

* doc/emacs/maintaining.texi (VC Change Log):
Add 'C-x v b l' (vc-print-branch-log).
(Creating Branches): Add @kindex and @findex for vc-create-branch.
(Switching Branches): Add @kindex and @findex for vc-switch-branch.

* lisp/vc/vc-hooks.el (vc-menu-map): Add menu items for new
commands vc-create-branch and vc-switch-branch, and also
vc-print-branch-log.

* lisp/vc/vc.el (vc-print-branch-log): Improve docstring.

Fix rare crashes in 'try_window_reusing_current_matrix'

* src/xdisp.c (try_window_reusing_current_matrix): Make sure we
never use a mode-line glyph row to start displaying scrolled-in
rows.  (Bug#63711)

Make last Tramp change less invasive

* lisp/net/tramp.el (tramp-dissect-file-name): Revert last change.
(tramp-handle-file-name-as-directory)
(tramp-handle-file-name-directory): Let-bind `tramp-default-proxies-alist'.

; Fix last change.

; * lisp/menu-bar.el (popup-menu): Doc fix.

; Fix last change.

; * etc/PROBLEMS: Document problem with GnuPG 2.4.1.  (Bug#63256)

; Support SQLite3 extensions on macOS

* src/sqlite.c (Fsqlite_load_extension): Support *.dylib
extensions.  (Bug#63653)

Fix 'use-dialog-box-p' and friends

* lisp/subr.el (use-dialog-box-p): Use dialog boxes also when
invoked from some window-system gesture.  (Bug#63655)
(y-or-n-p): Fix the description in the doc string of conditions
under which a dialog box will be used.

* src/fns.c (Fyes_or_no_p): Use the same condition for dialog
boxes as in 'use-dialog-box-p'.  Fix the description in the doc
string of conditions under which a dialog box will be used.

* doc/lispref/minibuf.texi (Multiple Queries, Yes-or-No Queries):
Fix the description of conditions under which a dialog box will be
used.

Avoid duplicates when adding package dirs to load-path

Do not merge to master, we're going to delete this code there.

* lisp/emacs-lisp/package.el (package-activate-1): Check if the path
we're about to add is already in 'load-path', since package autoload
files have been updating 'load-path' for a decade.

Avoid duplicate load-path entry when generating package autoloads

'file-name-directory' produces a path ending in '/', so that needs to be
run through 'directory-file-name' to avoid duplicate entries in
'load-path'.  (Bug#63625)

* lisp/emacs-lisp/package.el (package-generate-autoloads): Call
'directory-file-name' on the directory of 'load-file-name'.

; Improve documentation of Isearch command properties

* doc/emacs/display.texi (Scrolling):
* doc/emacs/search.texi (Not Exiting Isearch): Improve
documentation and indexing of 'scroll-command', 'isearch-scroll',
and 'isearch-move' properties.

Disable loading SQLite3 extensions when SQLite3 version is too old

* src/sqlite.c (HAVE_LOAD_EXTENSION): Define to 1 only if
enabling/disabling extension loading is supported as well.
(load_dll_functions, Fsqlite_load_extension): Condition on
HAVE_LOAD_EXTENSION, not on HAVE_SQLITE3_LOAD_EXTENSION.
(Bug#63653)

; * lisp/progmodes/project.el (project-switch-use-entire-map): Doc fix.

Fix visiting HTML files encoded in iso-2022 variants

* lisp/international/mule.el (sgml-xml-auto-coding-function)
(sgml-html-meta-auto-coding-function): Handle coding-systems whose
coding-system-type is iso-2022.  (Bug#63644)

; Fix markup of some treesit vars in Elisp manual.

* doc/lispref/modes.texi (Parser-based Font Lock):
(Parser-based Indentation):
* doc/lispref/parsing.texi (Multiple Languages): Use @code in place
of @var when the argument is not a metavariable.

Support 'isearch-allow-scroll' in 'pixel-scroll-precision-mode'

* lisp/pixel-scroll.el (pixel-scroll-precision)
(pixel-scroll-down, pixel-scroll-up): Put the 'scroll-command'
property on these commands.  (Bug#63640)

shr: allow moving between adjacent anchors

* lisp/net/shr.el (shr-urlify): Put shr-tab-stop only over first
position.

; * etc/NEWS: Fix typos.

Fix multihop file name expansion in Tramp

* lisp/net/tramp.el (tramp-dissect-file-name): Set hop to nil if
NODEFAULT.  (Bug#63578)

Remove obsolete information from Gnus manual

The Gnus manual was still referencing long-removed external
marks in section "Archiving Mails".  Without external marks,
that section is almost pointless, so remove it completely.
* doc/misc/gnus.texi (Archiving Mail): Remove section.
(Top, Browsing the Web): Remove references to "Archiving
Mail".  (Bug#63497)

Preserve mark in comint-history-isearch

This preserves mark in `comint-history-isearch-backward' and
friends, which tend to set the mark on completion of the isearch
to unexpected positions.
* lisp/comint.el (comint-history-isearch-end): Set `isearch-opoint'
to point.  (Bug#63616)

Fix systemd unit completion for old versions of systemd

* lisp/pcmpl-linux.el (pcmpl-linux--systemd-units): Use '--no-legend'
for compatibility with older versions of systemctl.  (Bug#63411)

Fix Skeletons menu-bar menu in Python modes

* lisp/progmodes/python.el (python-mode, python-ts-mode): Call
'python-skeleton-add-menu-items' here, not in 'python-base-mode',
since the "Python" menu is not yet set up in the latter.
(Bug#63598)

; * etc/NEWS: missing definite article

; * etc/NEWS: PGTK cannot switch to -new automatically (bug#6355).

Fix loading SQLite extensions

* src/sqlite.c (sqlite3_db_config) [WINDOWSNT]: Load from the DLL.
(Fsqlite_load_extension): Use 'sqlite3_db_config' to enable and
disable loading of extensions.  Add a few free extensions to the
allow-list.  Fix testing for the ".dll" extension.  (Bug#63590)

* test/src/sqlite-tests.el (sqlite-load-extension): Fix the test
to require successful load if the extension does exist.

; * etc/NEWS: Fix typos.

* etc/NEWS: Note dotimes loop variable scoping change (bug#63586)

Fix c-ts-mode--top-level-declarator

* lisp/progmodes/c-ts-mode.el:
(c-ts-mode--top-level-declarator): Don't use treesit-node-match-p.

Improve c-ts-mode font-lock for function names (bug#63390)

When a function definition has preproc directives in its body, it
can't correctly parse into a function_definition.  This fix tries to
recognize this case and highlight the function_declarator correctly.

* lisp/progmodes/c-ts-mode.el:
(c-ts-mode--font-lock-settings): New rule.
(c-ts-mode--top-level-declarator): New function.

* lisp/tab-bar.el: Don't use 'minibuffer-selected-window' (bug#62427).

(tab-bar-select-tab, tab-bar-new-tab-to):
Use 'window-minibuffer-p' instead of 'minibuffer-selected-window'.
And switch to 'get-mru-window' instead of 'minibuffer-selected-window'.

Split windows horizontally in places that use split to create a new window.

* lisp/tab-bar.el (tab-bar-new-tab-to):
* lisp/window.el (window-state-put):
To create a new window, split horizontally instead of vertically.
Use 'window-safe-min-width' for the SIZE arg of 'split-window'.
(bug#62592)

Fix tree-sitter test (bug#63481)

* test/src/treesit-tests.el (treesit-basic-parsing): Latest json
parser doesn't return an error on empty buffer or multiple objects
anymore [1].

https://github.com/tree-sitter/tree-sitter-json/commit/40a81c01a40ac48744e0c8ccabbaba1920441199

; * lisp/emacs-lisp/benchmark.el (benchmark-progn): Fix declare form.

Attempt to fix redisplay problems on macOS

* src/nsterm.m (ns_scroll_run): Attempt to fix redisplay
artifacts.  (Bug#63187)

; * lisp/simple.el (async-shell-command): Add commentary about 3rd arg.

Clarify misleading comment in isearch.el

Clarify a misleading comment in isearch.el as to whether frame events
should exit an isearch or not (Bug#62032, Bug#41338 for background
information).
* lisp/isearch.el (isearch-mode-map): Replace the misleading comment.
(Bug#62032)

Copyright-paperwork-exempt: yes

Improve documentation of package-menu commands

* doc/emacs/package.texi (Package Menu): Document that some
package-menu filters accept lists of values interactively.

* lisp/emacs-lisp/package.el (package-menu-execute)
(package-menu-hide-package, package-menu-describe-package)
(package-menu-mark-delete, package-menu-mark-install)
(package-menu-mark-unmark, package-menu-backup-unmark)
(package-menu-quick-help, package-menu-get-status)
(package-menu--find-upgrades, package-menu-mark-upgrades)
(package-menu-filter-by-archive)
(package-menu-filter-by-description)
(package-menu-filter-by-keyword)
(package-menu-filter-by-name-or-description)
(package-menu-filter-by-name, package-menu-filter-by-status)
(package-menu-filter-by-version, package-menu-filter-marked)
(package-menu-describe-package): Doc fixes.

Fix M-x completion-predicate under python-ts-mode

* lisp/progmodes/python.el (python--completion-predicate)
(python-shell--completion-predicate): Filter M-x completion based on
python-base-mode instead of python-mode.  This allows for
python-ts-mode as well (bug#63552).

* Account for `byte-compile-warnings' during native compilation (bug#63302).

* lisp/emacs-lisp/comp.el (comp-final, comp-run-async-workers):
Forward `byte-compile-warnings' to child processes.

Avoid duplicate VC packages in 'package-selected-packages'

* lisp/emacs-lisp/package-vc.el (package-vc--unpack-1): Check if
'package-selected-packages' already contains the package name.
(bug#63338)

* lisp/tab-bar.el (tab-bar-new-tab-to): Set 'window-side' to nil (bug#62427).

This is still needed for the case when tab-bar-new-tab-choice is 'window'.

; Better warning message when loading tree-sitter fails

* lisp/treesit.el (treesit-ready-p): Improve diagnostics on
MS-Windows when the tree-sitter library cannot be loaded at run
time.

Update to Org 9.6.6

; * admin/make-tarball.txt: Minor copyedits.

Merge branch 'emacs-29' of git.sv.gnu.org:/srv/git/emacs into emacs-29

; Regenerate files for emacs-29.0.91

* ChangeLog.4:
* etc/AUTHORS: Regenerate.

; * lisp/ldefs-boot.el: Regenerate for emacs-29.0.91.

Bump Emacs version for next pretest

* README:
* configure.ac:
* nt/README.W32:
* msdos/sed2v2.inp: Bump Emacs version to 29.0.91.

; * lisp/progmodes/csharp-mode.el (csharp-ts-mode--defun-name): typo

; Minor fixes in ELisp manual

* doc/lispref/functions.texi (Declare Form): Improve indexing.
(Obsolete Functions): Add cross-reference.
`

; * lisp/simple.el (async-shell-command): Doc fix.  (Bug#63432)

Ignore current-prefix-arg in async-shell-command

* lisp/simple.el (async-shell-command): Ignore current-prefix-arg and
always pass nil to second argument of `shell-command'.  (Bug#63432)

Fix building of VC package manuals with relative includes

* lisp/emacs-lisp/package-vc.el (package-vc--build-documentation):
Invoke makeinfo with -I to ensure the package directory is always
consulted for @include statements.  (Bug#63337)

Another fix for VHDL mode highlighting

* lisp/progmodes/vhdl-mode.el (vhdl-version): Bump to 3.38.5.
(vhdl-compiler-alist): Fix the regexps and the doc string.

Copyright-paperwork-exempt: yes

Fix auto-filling in Texinfo mode

This fixes auto-filling in Texinfo buffers.  It was broken by the
fix to bug#49558, which made M-q fill over-long @noindent lines by
refraining from customizing 'paragraph-separate' in Texinfo mode.
The underlying problem here is that 'auto-fill-mode' doesn't call
mode-specific filling functions, but does its job by itself, and
depends on 'forward-paragraph' to find the beginning of the
paragraph as appropriate for calculation of 'fill-prefix', and a
different value of 'paragraph-separate' broke that.  As a side
effect, the change below also changes paragraph-movement commands
in Texinfo back to how they behaved prior to that bugfix, but I
don't see why the paragraph-movement behavior introduced by that
fix made more sense.  Try to move through a series of
@-directives, like a paragraph preceded by several @cindex
entries, and you will see the inconsistencies.  In any case, the
adverse effects of that fix on auto-filling is unacceptable.

* lisp/textmodes/texinfo.el (fill-paragraph-separate): New
variable.
(texinfo-mode): Set 'fill-paragraph-separate' to the default value
of 'paragraph-separate'.  Customize 'paragraph-separate' to the
Texinfo-specific value, as it was before commit dde591571abf.
(texinfo--fill-paragraph): Bind 'paragraph-separate' to the value
of 'fill-paragraph-separate', to keep 'M-q' happy.

; * admin/git-bisect-start: Update failing commits

Merge branch 'scratch/long-lines-cleanup' into 'emacs-29'

Add an assertion in, and a commentary for, 'get_nearby_bol_pos'

* src/xdisp.c:
(get_nearby_bol_pos): Document the function, and add an assertion
on its return value.

Fix the return type of 'labeled_restrictions_get_bound'

* src/editfns.c:
(labeled_restrictions_get_bound): Return a Lisp_Object instead of
a pointer to a struct Lisp_Marker.
(unwind_reset_outermost_restriction, reset_outermost_restrictions)
(Fwiden, Fnarrow_to_region): Adapt to the new return type.

Fix mouse highlight with some fonts in Cairo builds

* src/ftcrfont.c (ftcrfont_draw): Don't set the
'background_filled_p' flag of the glyph string.  (Bug#63271)

; * etc/NEWS: Fix wording in last change.

; Improve and update documentation of built-in package upgrades

* doc/emacs/package.texi (Package Statuses, Package Menu)
(Package Installation):
* etc/NEWS: Document the options and caveats of upgrading built-in
packages.

Ensure that package menu respects 'package-install-upgrade-built-in'

* lisp/emacs-lisp/package.el (package-menu--find-upgrades): Check if
built-in packages can be upgraded if
'package-install-upgrade-built-in' is non-nil.

Ensure that EXTRA-DATA are always written when generating autoloads

* lisp/emacs-lisp/loaddefs-gen.el (loaddefs-generate): Handle
edge-case where no autoloads are found.  (Bug#63260)

Update to Transient v0.4.0

Or strictly speaking v0.4.0-1-g428576a4.)

Revert "Don't have nntp-report signal an error"

This reverts commit 032969e8c65ba1ccda8466f6c61f20e0c7293ebf.
The commit is being reverted because it caused bug#62845.

; * lisp/wid-edit.el (widget-specify-insert): Fix debug spec.  (Bug#63437)

Make c-emacs-features use the proper binding of parse-sexp-lookup-properties

This is relevant for bug #58558, although it does not fix it.  Due to a wrong
ordering of with-current-buffer and a let form, the function overwrote the
global value of parse-sexp-lookup-properties and two other variables.

* lisp/progmodes/cc-defs.el (c-emacs-features): Change the nesting of
with-current-buffer and let so that the let bindings get used.